Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spatc1Q148B6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spatc1Q148B6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms