Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VgfQ0VGU4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VgfQ0VGU4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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