Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cab39Q06138 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cab39Q06138 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms