Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rcn1Q05186 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rcn1Q05186 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms