Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1cQ01815 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cacna1cQ01815 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cacna1cQ01815 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms