Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gbp10Q000W5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gbp10Q000W5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms