Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Otx1P80205 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx1P80205 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx1P80205 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otx1P80205 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otx1P80205 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms