Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ErfP70459 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ErfP70459 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ErfP70459 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ErfP70459 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ErfP70459 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ErfP70459 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ErfP70459 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ErfP70459 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ErfP70459 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ErfP70459 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ErfP70459 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ErfP70459 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ErfP70459 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ErfP70459 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ErfP70459 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ErfP70459 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ErfP70459 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ErfP70459 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ErfP70459 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ErfP70459 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ErfP70459 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ErfP70459 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ErfP70459 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ErfP70459 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ErfP70459 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ErfP70459 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ErfP70459 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ErfP70459 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ErfP70459 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ErfP70459 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ErfP70459 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ErfP70459 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms