Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SbdsP70122 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SbdsP70122 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SbdsP70122 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms