Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tubb4bP68372 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tubb4bP68372 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tubb4bP68372 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms