Protein–RNA interactions for Protein: P63260

Actg1, Actin, cytoplasmic 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actg1P63260 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Actg1P63260 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Actg1P63260 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms