Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab11aP62492 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms