Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NcstnP57716 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NcstnP57716 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms