Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TdgP56581 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TdgP56581 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TdgP56581 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TdgP56581 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TdgP56581 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TdgP56581 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TdgP56581 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TdgP56581 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TdgP56581 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TdgP56581 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TdgP56581 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TdgP56581 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TdgP56581 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TdgP56581 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TdgP56581 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TdgP56581 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TdgP56581 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TdgP56581 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TdgP56581 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TdgP56581 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TdgP56581 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TdgP56581 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TdgP56581 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TdgP56581 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TdgP56581 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TdgP56581 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TdgP56581 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TdgP56581 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TdgP56581 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TdgP56581 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TdgP56581 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TdgP56581 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TdgP56581 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TdgP56581 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TdgP56581 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TdgP56581 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TdgP56581 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TdgP56581 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TdgP56581 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TdgP56581 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TdgP56581 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TdgP56581 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TdgP56581 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TdgP56581 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TdgP56581 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TdgP56581 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TdgP56581 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TdgP56581 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TdgP56581 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TdgP56581 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TdgP56581 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TdgP56581 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TdgP56581 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TdgP56581 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TdgP56581 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TdgP56581 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TdgP56581 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TdgP56581 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms