Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd38P56528 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd38P56528 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd38P56528 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cd38P56528 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms