Protein–RNA interactions for Protein: P52482

Ube2e1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e1P52482 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2e1P52482 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2e1P52482 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2e1P52482 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2e1P52482 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2e1P52482 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e1P52482 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2e1P52482 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2e1P52482 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms