Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxc13P50207 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxc13P50207 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms