Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Abcd1P48410 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Abcd1P48410 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcd1P48410 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcd1P48410 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcd1P48410 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcd1P48410 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcd1P48410 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcd1P48410 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcd1P48410 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcd1P48410 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcd1P48410 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcd1P48410 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Abcd1P48410 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms