Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ddit3P35639 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ddit3P35639 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ddit3P35639 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms