Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp4P35123 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp4P35123 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp4P35123 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp4P35123 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp4P35123 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp4P35123 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp4P35123 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms