Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc3P33622 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Apoc3P33622 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms