Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Msr1P30204 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Msr1P30204 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Msr1P30204 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms