Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZfaP23607 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZfaP23607 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZfaP23607 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZfaP23607 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZfaP23607 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZfaP23607 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZfaP23607 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZfaP23607 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZfaP23607 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ZfaP23607 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms