Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx3P23198 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx3P23198 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx3P23198 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx3P23198 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx3P23198 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx3P23198 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx3P23198 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cbx3P23198 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cbx3P23198 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms