Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tap1P21958 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tap1P21958 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tap1P21958 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tap1P21958 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tap1P21958 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tap1P21958 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms