Protein–RNA interactions for Protein: P17563

Selenbp1, Selenium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp1P17563 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Selenbp1P17563 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Selenbp1P17563 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms