Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Calb1P12658 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb1P12658 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Calb1P12658 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb1P12658 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb1P12658 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Calb1P12658 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms