Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spp1P10923 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spp1P10923 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spp1P10923 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spp1P10923 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spp1P10923 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms