Protein–RNA interactions for Protein: P04945

Ig kappa chain V-VI region NQ2-6.1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04945 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04945 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04945 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04945 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04945 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04945 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04945 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04945 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04945 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04945 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04945 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P04945 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P04945 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P04945 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04945 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P04945 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04945 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P04945 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04945 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04945 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04945 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04945 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04945 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04945 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04945 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04945 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04945 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P04945 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04945 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04945 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04945 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04945 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04945 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P04945 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04945 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04945 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04945 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P04945 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04945 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04945 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms