Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01797 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01797 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01797 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01797 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01797 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01797 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01797 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01797 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01797 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01797 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01797 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01797 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01797 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01797 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01797 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01797 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01797 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P01797 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01797 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01797 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01797 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01797 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01797 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01797 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01797 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms