Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CpdO89001 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CpdO89001 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CpdO89001 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CpdO89001 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CpdO89001 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CpdO89001 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CpdO89001 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CpdO89001 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CpdO89001 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CpdO89001 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CpdO89001 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CpdO89001 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CpdO89001 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CpdO89001 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CpdO89001 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CpdO89001 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CpdO89001 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CpdO89001 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CpdO89001 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CpdO89001 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CpdO89001 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CpdO89001 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CpdO89001 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CpdO89001 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CpdO89001 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CpdO89001 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CpdO89001 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CpdO89001 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CpdO89001 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CpdO89001 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CpdO89001 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CpdO89001 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CpdO89001 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CpdO89001 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CpdO89001 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CpdO89001 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CpdO89001 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CpdO89001 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CpdO89001 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CpdO89001 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CpdO89001 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CpdO89001 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CpdO89001 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CpdO89001 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CpdO89001 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CpdO89001 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CpdO89001 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CpdO89001 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CpdO89001 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CpdO89001 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CpdO89001 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CpdO89001 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CpdO89001 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CpdO89001 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CpdO89001 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CpdO89001 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CpdO89001 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CpdO89001 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CpdO89001 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CpdO89001 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CpdO89001 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CpdO89001 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CpdO89001 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CpdO89001 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CpdO89001 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CpdO89001 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CpdO89001 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CpdO89001 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CpdO89001 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CpdO89001 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CpdO89001 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CpdO89001 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CpdO89001 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms