Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rhox6O70238 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox6O70238 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox6O70238 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox6O70238 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox6O70238 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox6O70238 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox6O70238 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox6O70238 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms