Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gfi1bO70237 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gfi1bO70237 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms