Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptpn20O55082 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ptpn20O55082 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms