Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rdh16O54909 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rdh16O54909 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Rdh16O54909 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh16O54909 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rdh16O54909 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rdh16O54909 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rdh16O54909 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rdh16O54909 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rdh16O54909 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rdh16O54909 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Rdh16O54909 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Rdh16O54909 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Rdh16O54909 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rdh16O54909 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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