Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Tnfrsf18O35714 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Tnfrsf18O35714 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Tnfrsf18O35714 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Tnfrsf18O35714 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Tnfrsf18O35714 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Tnfrsf18O35714 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Tnfrsf18O35714 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Tnfrsf18O35714 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tnfrsf18O35714 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Tnfrsf18O35714 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Tnfrsf18O35714 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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Tnfrsf18O35714 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfrsf18O35714 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfrsf18O35714 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfrsf18O35714 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfrsf18O35714 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfrsf18O35714 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tnfrsf18O35714 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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Tnfrsf18O35714 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tnfrsf18O35714 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms