Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edil3O35474 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Edil3O35474 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Edil3O35474 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Edil3O35474 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms