Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prrt1O35449 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Prrt1O35449 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Prrt1O35449 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Prrt1O35449 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Prrt1O35449 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Prrt1O35449 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms