Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Bhlhe40O35185 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Bhlhe40O35185 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms