Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Casp6O08738 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Casp6O08738 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms