Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm21310J3QQ23 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm21310J3QQ23 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms