Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccer2J3QPU5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccer2J3QPU5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccer2J3QPU5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms