Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm17577J3QNF7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm17577J3QNF7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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