Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccdc180J3QNE4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccdc180J3QNE4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Ccdc180J3QNE4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Ccdc180J3QNE4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms