Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930544D05RikJ3QK56 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930544D05RikJ3QK56 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms