Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm20696H3BJN7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm20696H3BJN7 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms