Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r12G5E8G1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms