Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r39G3UWE6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r39G3UWE6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r39G3UWE6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r39G3UWE6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r39G3UWE6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms