Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm28048F7BCN0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm28048F7BCN0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms