Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn2r48E9Q5D8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn2r48E9Q5D8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmn2r48E9Q5D8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r48E9Q5D8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r48E9Q5D8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r48E9Q5D8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r48E9Q5D8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r48E9Q5D8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r48E9Q5D8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn2r48E9Q5D8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms